Has probado el lector con otros cds, o en otro pc???
Es raro que pase siempre y con todos los cds de windows... eso parece problema del lector. Puede ser que solo esté la lente sucia.
Lo dicho, prueba con otros cds, en otros pc´s, a ver que pasa, si te falla, prueba pasarle un cd limpiador.
Otra opción es instalar el wine en linux. Emula maquinas virtuales y podrás tener un "pc virtual" con windows, o el sistema que quieras sin tener que tocar tu linux.
Pon en consola: sudo apt-get install wine
Puedes encontrar manuales de wine por 1000 sitios de la red... aunque tampoco es muy complicado de usar.
Te dejo un par de enlaces:
http://logantux.wordpress.com/2007/01/15/instalar-wine-en-ubuntu/
http://blog.pucp.edu.pe/item/3421