Deshabilitar los lectores de tarjetas o puertos USB así como unidades ópticas, es muy común en las PC´s destinadas para uso empresarial. Lo que me llama la atención es que pensando en adquirir tantas unidades no cuentes con soporte técnico en tu empresa que te deshabilite estas unidades. En fin, una forma de hacer lo que quieres es la siguiente:
1. Entra a propiedades en mi PC (Inicio_Panel de control_Sistema)
2. Seleccionas la pestaña Hardware y pinchas en Administrador de Dispositivos
3. Seleccionas el apartado Tarjetas de Memoria PCMCIA y Flash en donde se desplegaran las diferentes tarjetas q posea tu equipo.
4. Con el botón derecho del mouse, eliges la tarjeta en cuestión y del menu que se despliega eliges la opción Deshabilitar.
5. Reinicias el PC, a partir de este momento las tarjetas estarán deshabilitadas y no podrán utilizarse.
6. Lo mismo puede hacerse para el resto de los puertos.
Espero te sea de ayuda...