No se.... a mi me dio el mismo problema con el petousb y otros, pero con el unetbootin, me funcionó genial.
De todos modos, métele una versión lite de windows, cuando lo tengas todo configurado (drivers y todo), hazte una copia de seguridad en un pendrive con acronis true image, y te olvidas de problemas.
De todos modos, el problema puede estar en el pendrive, eh... no todos valen. El sandisk cruzer, parece ser que es de lo mejor para este caso.